La fundación de la ciudad es producto de la unión de dos tribus rivales: Los Cholulas y Chaparrastiques, cansados de tantas batallas sangrientas entre ellos, decidieron unirse y construir sus casas, en la mitad de sus territorios a orillas del río Chapulapa (ahora llamado el río indígena Nacaome). El nuevo pueblo se llamó NACA-OME, que significa “Unión de dos carnes”. La fusión de estas dos tribus ocurrió antes de la llegada de los españoles a la región. Llegaron en 1535, estableciendo y construyendo la primera iglesia, y en el mismo año, el primer municipio se organizó allí.
Se dedican principalmente al comercio, cultivo de maíz, frijoles, producción de sal, exportación de camarones y melones.
Nacaome es una ciudad, localizada en la zona sur de Honduras, en el departamento de Valle, es también el nombre del río que atraviesa el Municipio.